有機化合物種類繁多，結構復雜，因此有機化合物的命名是一項非常具有挑戰性的工作。國際純粹與應用化學聯合會（International Union of Pure and Applied Chemistry）是國際上公認的化學命名權威組織，制定的 IUPAC 命名法是系列命名化學物質的方法，規定了從有機到無機、從低分子到高分子及各方面化學術語。
在我國，則是由中國化學學會（Chinese Chemical Society）根據 IUPAC 制定的命名規則，結合中國的語言特點，制定有機化合物的中文命名規則。
在日常翻譯過程中，譯員對一個結構非常復雜、自己又完全陌生的有機化合物進行命名時，首先要根據原文最后一個單詞確定化合物屬于哪個大類，如醇、酸、酯、醚、酮，還是其他類型。
官能團或取代基的位置，通常用數字 1、2、3 等描述，比如 2-甲基…、1-丙醇、3-氯-1-丁醇等等；也可以用希臘字母 α、β、γ 等表示位次，但要注意，官能團如醇等的位次為 1。多元苯取代化合物中取代基的相對位置可以用鄰、間、對位次表述，如鄰甲基苯酚。
雜環化合物在有機化合物中非常常見，如呋喃、吡喃等等。
烴的命名，碳原子數在 10 以內，用甲乙丙丁戊己庚辛壬癸十天干命名，10 以上用阿拉伯數字的漢字表述。
碳原子數目表示法：
有機化合物大多數具立體結構，因此在命名有機化合物時，通常也需注明立體結構。通常有以下幾種情形：
順反異構：
1、雙鍵順反異構：雙鍵平面同側時構型用 Z（德文zusammen）表示、雙鍵平面異側時構型用 E（德文entgegen）表示，分別加括號（Z）、（E）放在化合物名稱前面。
2、單環順反異構：單環上兩個相鄰位置分別接一個取代基時，立體關系用順（cis）-、反（trans）-表示。
手性中心：
1、旋光異構體的旋光方向用右旋（+）、左旋（-）以及內消旋（±）表示。
2、用 R、S 符號表示手性原子構型。
順時針排列稱為 R 型、逆時針排列稱為 S 型（R、S 分別為拉丁文 Rectus、Sinister 的縮寫，意為“右”、“左”）。相對構型已知、絕對構型未知時用 R*、S* 表示。
產品名稱舉例
我們就以阿奇霉素化學結構式舉例：
